เนื่องจากอะมิโนสเปรตน้ำเหลืองเด็กเกิดจากโรคทางพันธุกรรม ยังไม่มีวิธีรักษาที่สามารถรักษาได้ทั้งหมด ต้องรักษาตามอาการ และวิธีการรักษาหลักในปัจจุบันคือ
1. การควบคุมอาหาร
เนื่องจากความแตกต่างของชนิดของอะมิโนสเปรต อาการของโรคไขมันไขมูลอะมิโนสเปรตควรได้รับการบริโภคอาหารที่มีตัวอะมิโนมีโทรปินที่ต่ำ ผู้ป่วยที่มีอาการไขมันไขมูลลิวอินิลลิโนลิลทริโพโทส ฟีนิลอลิลลิโนลิลทริโพโทส และไทโรซิลลิโนลิลทริโพโทสควรได้รับการบริโภคอาหารที่มีโปรตีนสูง และปรับปรุงนิโคตินิก แต่หากมีอาการขาดความสมดุลและอาการประหลาดภาพจิตใจควรห้ามบริโภคโปรตีน
สอง ปรับปรุงน้ำในปัสสาวะ
ขยายน้ำมากเพื่อปรับปรุงปัสสาวะมาก (รวมถึงคืน) ต้องประกัน24h และปัสสาวะมีปริมาณ4L ขึ้น พิจารณายังแนะนำดื่มน้ำก่อนหลังนอนที่ช่วงกลางคืนเพื่อทำให้ปัสสาวะมีปริมาณตั้งแต่1.5L ขึ้น; เพราะการไม่ดื่มน้ำเวลาคืนนานอย่างยาวนานทำให้ปัสสาวะหนาแน่นมาก นี่เป็นสาเหตุหลักที่ทำให้เกิดหินปากหลอดน้ำของไอโซลาเต็ดไซสทีน
สาม การรักษาตามอาการ
1ปรับแต่งด้วยการเปลี่ยนแปลงของ pH และเพิ่มเติมด้วยยาอื่นๆ10%ของโกลิเจนต์เมียมคาร์บอนาต์ ที่10ml3ครั้ง/d ใช้เป็นยาเริ่มต้น
2การเจาะใส่และยาปาก
สี่ การรักษาด้วยยา
เมื่อปริมาณการปัสสาวะไอโซลาเต็ดไซสทีนเกินมาก (>750mg/d หรือ3mmol/d) หรือใช้น้ำชาและเคมีที่ทำให้น้ำมันเปลี่ยนสีสีสว่างเมื่อไม่สามารถป้องกันหินปากหลอดน้ำอย่างมีประสิทธิภาพ เช่น D-penicillamine, tiopronin, α-mercaptoacetylpyrroleglycerol(alpha-mercaptopropionylglycine) ระยะหลังนี้มีผู้ที่พยายามใช้คาโทปริล ยานี้เกิดเป็นสารประมางที่มีความมากขึ้นของไอโซลาเต็ดไซสทีนในปัสสาวะ ลดความสะเทือนของไอโซลาเต็ดไซสทีนในปัสสาวะอย่างมาก แต่ยานี้อาจทำให้เกิดอาการระบบประสาทเหมือนโรคหลอดเลือดแบบสีเลือด ลดระดับเมลาโนไซต์ชั่วคราว อาการโปรตีนุรียาศิษย์และโรคเนฟรอทิกซ์ต่อตัวเองที่สามารถกลับคืนมาได้
1อาซิโตริก: ไม่เพียงและลดไอโซลาเต็ดไซสทีนในปัสสาวะได้ แต่ยังป้องกันการก่อตัวหินไตด้วย แต่ยานี้มีผลข้างเคียงที่มีอัตราสูงมาก สามารถใช้ยาอื่นๆ เช่น อะซิโทริกและกลูทามิก กลูตามิก อะลานิน คลอริด์นิโทรพิน (Lysine) และโคลอริด์นิโทรพิน (Lysine)
2N-อะซิโตริก-D-อาซิโตริก: มีภาวะไร้ทางยาน้อย ผลของการรักษาเหมือนกัน อาซิโตริก (ไขมันโกลิก) ซึ่งมีภาวะไร้ทางยาน้อยกว่า
3ยานาโยไลน์: โรคไตอินทรีสังเคราะห์ (Hartnup disease) อาจปรากฏโรคผิวหนังแสงและโรคร่วมใจในเส้นใยประสาทลลำตัวเล็ก และโรคสงสัยหลังครวงใจ การรักษาด้วยยานาโยไลน์ สามารถป้องกันโรคผิวหนังและอาการทางสปีริจน์และสงสัยหลังครวงใจได้
ห้า การรักษาหินไต
นอกจากการใช้วิธีตัดตัดหินไตหรือเจาะหินไตด้วยวิธีแพทย์แล้ว ยังสามารถใช้ยาตายตายตะลาวยาแบบสำรับเพื่อดินหินไตได้ ยาความเป็นกรดของไขมันอะสิโดนิก ซึ่งไม่มีผลบวกน้อยลง ต้องรักษาด้วยวิธีแพทย์ทางฝีมือเมื่อเรียบร้อยแล้ว Asanuma และคณะรายงาน13คน มีการรักษาด้วยวิธีแพทย์แผนกจัดตัวภายในร่างกาย