มะเร็งออมฟาลัสเป็นมะเร็งที่มาจากเซลล์สืบทอดที่มีความเป็นไปได้ที่จะแบ่งเซลล์ในทางหลายทาง มักมีองค์ประกอบของสามสมาธิรูปที่หลากหลาย มีความเป็นระเบียบที่ผิดปกติ ตามที่มีลักษณะทางด้านด้านนอก สามารถแบ่งออกเป็นสองประเภท คือมะเร็งออมฟาลัสที่มีถังและมะเร็งออมฟาลัสที่ไม่มีถัง ตามระดับที่เนื้อเยื่อเจริญพัฒนา สามารถแบ่งออกเป็นมะเร็งออมฟาลัสที่ดีและมะเร็งออมฟาลัสที่ร้าย มะเร็งออมฟาลัสมักเกิดที่ตับและเพศ บางครั้งมีที่ช่องกลางทางแกน หลังสมอง หรือเส้นผ่านศีรษะ มะเร็งออมฟาลัสไม่พบบ่อย ไม่มีอัตราการเกิดสูง และแบ่งเป็นหลายสาขาทางการรักษา มะเร็งออมฟาลัสที่พบบ่อยที่สุดในแพทย์ทั่วไปเป็นมะเร็งออมฟาลัสที่ติดหลังสมองและหลังเส้นผ่านศีรษะ ส่วนใหญ่เป็นมะเร็งออมฟาลัสที่ดี แต่หากเกิดที่เพศ มักเป็นมะเร็งออมฟาลัสที่ร้าย มะเร็งออมฟาลัสอาจเกิดที่ตับ ตับเฟศ หลังสมอง หลังเส้นผ่านศีรษะ หรือหลังเส้นผ่านศีรษะ มะเร็งออมฟาลัสที่ติดหลังสมองอาจพบในรุ่นที่เด็ก มะเร็งออมฟาลัสที่ติดหลังเส้นผ่านศีรษะอาจพบในรุ่นที่เด็ก บางครั้งพบในระหว่างการพัฒนา และบางครั้งพบหลังจากการเกิดมะเร็งร้าย
ส่วนใหญ่เชื่อว่ามะเร็งออมฟาลัสมาจากเซลล์สืบทอดที่มีความเป็นไปได้ที่จะแบ่งเซลล์ในทางหลายทางในขั้นตอนพัฒนาตัวเอกพรรษา บางส่วนของเซลล์มากพลภาพนี้ที่หลุดออกมา และเพิ่มจำนวนและพัฒนาเป็นมะเร็งในช่องกลางทางแกน มะเร็งนี้มักเป็นมะเร็งออมฟาลัสที่ดี มักตั้งอยู่ในช่องกลางทางแกนขนาดหน้าของเส้นเลือดและเลือดออก มะเร็งออมฟาลัสส่วนใหญ่เป็นเนื้อเยื่อเดี่ยว และอาจมีถังที่มีขนาดต่าง ๆ ที่มีเนื้อเยื่อเปิดผนึกของเอกพรรษานอก ของเอกพรรษากลาง หรือเอกพรรษาภายใน อย่างเช่น ผม ฟัน ขากรรม หรือเยื่อเนื้อเยื่อ หรือเยื่อทางหลอดเลือดหรือหลอดอาหาร บางส่วนของมะเร็งออมฟาลัสอาจเปลี่ยนเป็นมะเร็งร้าย มะเร็งออมฟาลัสที่ทำด้วยเนื้อเยื่อที่ไม่เจริญพัฒนาเป็นมะเร็งร้าย และเติบโตเป็นมะเร็งที่มีความรุนแรง มะเร็งออมฟาลัสอาจติดเชื่อมกับเนื้อเยื่อใกล้เคียงหรือทะลุเข้าไปในอวัยวะใกล้เคียงเช่นปอด หรือหลอดเลือด และทำให้ผู้ป่วยเหลือมะนาวหรือสารหลังผิว