يحدث التهاب المعدة الحاد المعدي غالبًا كعدوى ثانوية لعدوى الجهاز المناعي الشامل أو يحدث في حالات زرع الأعضاء، العلاج الكيميائي المتقدم للسرطان، فيروس نقص المناعة البشرية (الإيدز) وغيرها من حالات انخفاض المناعة الجهازية العامة. من بين المصادر الشائعة للعدوى:
1، البكتيريا:تصل العدوى من مناطق أخرى من الجسم عبر الدورة الدموية أو اللمفاوية إلى المخاطية المعوية وتسبب التهاب حاد. من بين البكتيريا الشائعة: بكتيريا الالتهاب الرئوي، البكتيريا العنقودية، بكتيريا السل، بكتيريا الالتهاب الحاد، وبكتيريا أخرى. يمكن أن تسبب تناول البكتيريا هيليكوباكتر بيلوري أمراض المعدة الحادة مؤقتة، لكن لم يتم رؤية أي تقارير حول بكتيريا هذا النوع تسبب التهاب المعدة الحاد في السرير.
2، الفيروسات:في المرضى المصابين بمرض الالتهاب المعدي الحاد للغدة الهضمية بسبب انخفاض مناعة الجسم يمكن العثور على فيروسات الجلوتيكس والمجتماعة. يظهر التشريح في الغالب كالتهاب شامل للغدة الهضمية، حيث يحدث تورم وتمدد في المفاصل المخاطية، حتى يمكن أن يحدث نزيف واسع والتآكل، ويمكن رؤية الكائنات الحية الدقيقة والمحاربات في الخلايا. وتظهر النتيجة التي تسببها البكتيريا هيليكوباكتر بيلوري كزحف كبير من الخلايا المحاربة والخلايا الإيروسينية في المخاط، مع تشكيل فقاعات صغيرة. بالنسبة للمرضى المصابين بفيروس الجلوتيكس، يمكن رؤية الكثير من البكتريا في الخلايا، ويتمدد تجويف المخاطي.