โรคภูมิไข้ขันต์อาการแบบประจำช่วงมักเกิดขึ้นหลังการติดเชื้อของระบบไต้หลัง หรือเกิดขึ้นในคนที่ผ่านการขยายองคา ระยะหลังการใช้ยาเคมีบำบัดมะเร็ง หรือโรคเอดส์ที่มีภาวะภูมิคุ้มกันต่ำ โดยมีแหล่งการติดเชื้อที่ติดเชื้อมากที่สุด ได้แก่
1、บาคทีเรีย:โดยมีการมาถึงเยื่อเซลล์ของช่องท้องผ่านทางการวงแหวนเลือดหรือน้ำเลือด ซึ่งเป็นตำแหน่งของการติดเชื้อในองคาไข้ขันต์ที่มีอาการแบบประจำช่วง บางครั้งมีการที่มีบาคทีเรียที่ติดเชื้อเช่น สแตฟโคโลบาคเตอร์ สแตฟโคโลบาคเตอร์ แบคทีเรียไซโฟแบล็ก แบคทีเรียไทฟอส์ และบางบาคทีเรียอื่นๆ การกินสแตฟโคโลบาคเตอร์ได้แสดงอาการโรคภูมิไข้ขันต์อาการแบบประจำช่วงชั่วคราว แต่ยังไม่มีรายงานที่ว่าสแตฟโคโลบาคเตอร์ที่มีอาการโรคภูมิไข้ขันต์อาการแบบประจำช่วง
2、ไวรัส:ในคนที่มีภาวะภูมิคุ้มกันต่ำที่เป็นโรคภูมิไข้ขันต์อาการแบบประจำช่วง จะพบไวรัสไซโตแมลเลีย และไวรัสโฮสติลิอิทิกในช่องท้อง โดยเฉพาะที่มีอาการเนื้อเยื่อเซลล์ที่มีขนาดใหญ่และการเจริญรุนแรงของเซลล์นิวโครไทน์ ที่เป็นผลจากสแตฟโคโลบาคเตอร์ไฮโปเลนท์ จะมีอาการที่เซลล์นิวโครไทน์และเซลล์เออสโตเฟิลิอิทิกมีการเจริญรุนแรงในเยื่อเนื้อเยื่อชั้นใต้ และมีการเกิดเหงือกน้อย โดยมีผู้ที่ติดเชื้อไวรัสไซโตแมลเลียจะมีการพบเจอสารเนื้อเยื่อที่มีขนาดใหญ่ในภายในเซลล์ และมีการเพิ่มรอยทับของเยื่อเมล็ดท้องถิ่น